Η ρύθμιση προβλέπει τον ορισμό τριών Αντιπροέδρων με απόφαση της Διοικούσας Επιτροπής. Οι Αντιπρόεδροι θα υποβοηθούν το έργο του Προέδρου. Με απόφαση της Διοικούσας Επιτροπής καθορίζονται οι αρμοδιότητες των Αντιπροέδρων, η σειρά με την οποία αυτοί αναπληρώνουν τον Πρόεδρο, αν αυτός απουσιάζει, κωλύεται ή ελλείπει για οποιονδήποτε άλλο λόγο.
Σε περίπτωση παραίτησης ή για οποιονδήποτε λόγο έλλειψης του Προέδρου, οι Αντιπρόεδροι ασκούν τα καθήκοντά του μέχρι την έκδοση της προβλεπόμενης απόφασης για το διορισμό νέου Προέδρου από τον Υπουργό Παιδείας, Έρευνας και Θρησκευμάτων. Ο Πρόεδρος και οι Αντιπρόεδροι της Διοικούσας Επιτροπής απαλλάσσονται των διδακτικών και διοικητικών του καθηκόντων στα Α.Ε.Ι ή στα Ερευνητικά Κέντρα που υπηρετούν.